Digitale microscopie: Difference between revisions
Jump to navigation
Jump to search
| (6 intermediate revisions by the same user not shown) | |||
| Line 16: | Line 16: | ||
Zie ook een '''[http://www.pathxl.co.uk/iscope/pxlviewer/default.aspx?guid=a1fd1296-1489-4477-82d8-ce96f3efe245&resid=152429 voorbeeld]''' van zo'n digitale coupe.<br> | Zie ook een '''[http://www.pathxl.co.uk/iscope/pxlviewer/default.aspx?guid=a1fd1296-1489-4477-82d8-ce96f3efe245&resid=152429 voorbeeld]''' van zo'n digitale coupe.<br> | ||
<sup>''Gebruik de linkermuisknop om de coupe in een nieuwe tab te openen.''</sup> | <sup>''Gebruik de linkermuisknop om de coupe in een nieuwe tab te openen.''</sup> | ||
Zie ook de pagina van <span class="newwin">[https://cat-database.sites.uu.nl/nl/tool/pathxl/ CAT]</span> | |||
== Hoe kun je dit inzetten? == | == Hoe kun je dit inzetten? == | ||
Practica kunnen nu zonder microscoop gegeven worden.<small> | |||
* Geen uitleen meer van microscopen | |||
* Geen stapels dozen met preparaten, waarvan er elk jaar weer een aantal sneuvelen | |||
* Op het scherm samen structuren aanwijzen, ook handig voor de docent | |||
* Alle studenten krijgen dezelfde preparaten | |||
* Met annotaties kunnen studenten wegwijs gemaakt worden | |||
* Makkelijk om veel preparaten per student aan te bieden, om variatie te kunnen geven</small><br> | |||
Door de bestaande preparaten in te scannen zijn deze ook breder beschikbaar.<small> | |||
* Snel vergelijken van verschillende organismen | |||
* Scans blijven altijd goed, terwijl preparaten verouderen | |||
* Bewaren van preparaten niet meer noodzakelijk | |||
</small> | |||
== Wat is er al ingescand? == | == Wat is er al ingescand? == | ||
Bij Biologie is een start gemaakt met het inscannen van de gehele collectie. Deze bleek echter zo groot dat er eerst een inventarisatie wordt gemaakt van al het bestaande materiaal.<br> | Bij Biologie is een start gemaakt met het inscannen van de gehele collectie. Deze bleek echter zo groot dat er eerst een inventarisatie wordt gemaakt van al het bestaande materiaal.<br> | ||
Een overzicht van wat er aan coupes | Een overzicht van wat er aan coupes al gescand is kun je downloaden via [https://www.projects.science.uu.nl/coos/IndexScans.xlsx deze] link. | ||
We zijn ook een overzicht aan het maken van de coupes die in het KBG opgeslagen liggen. Een overzicht hiervan kun je downloaden via [https://www.projects.science.uu.nl/coos/Preparaten_2022.xlsx deze] link. | |||
== Hoe ga ik aan de slag? == | |||
* [[Coupes inscannen|Inscannen]] | * [[Coupes inscannen|Inscannen]] | ||
| Line 39: | Line 46: | ||
* [[Annotaties toevoegen|Annoteren]] | * [[Annotaties toevoegen|Annoteren]] | ||
* [[Linken naar ingescande coupes|Linken]] | * [[Linken naar ingescande coupes|Linken]] | ||
Latest revision as of 12:31, 22 September 2023
Wat is het?
Het inscannen van microscopische coupes en die via bepaalde software online aan studenten aanbieden.
Hiervoor gebruikt de UU PathXL, dat is ontwikkeld om snel met meerdere deskundigen de pathologie te kunnen beoordelen van coupes gemaakt van biopten.
Met PathXL kun je snel online preparaten bekijken en:
- inzoomen
- draaien
- belichting aanpassen
- snelle navigatie door het preparaat
- snapshot maken
- annoteren van gebieden
- berekenen van oppervlakten en afstanden.
Zie ook een voorbeeld van zo'n digitale coupe.
Gebruik de linkermuisknop om de coupe in een nieuwe tab te openen.
Zie ook de pagina van CAT
Hoe kun je dit inzetten?
Practica kunnen nu zonder microscoop gegeven worden.
- Geen uitleen meer van microscopen
- Geen stapels dozen met preparaten, waarvan er elk jaar weer een aantal sneuvelen
- Op het scherm samen structuren aanwijzen, ook handig voor de docent
- Alle studenten krijgen dezelfde preparaten
- Met annotaties kunnen studenten wegwijs gemaakt worden
- Makkelijk om veel preparaten per student aan te bieden, om variatie te kunnen geven
Door de bestaande preparaten in te scannen zijn deze ook breder beschikbaar.
- Snel vergelijken van verschillende organismen
- Scans blijven altijd goed, terwijl preparaten verouderen
- Bewaren van preparaten niet meer noodzakelijk
Wat is er al ingescand?
Bij Biologie is een start gemaakt met het inscannen van de gehele collectie. Deze bleek echter zo groot dat er eerst een inventarisatie wordt gemaakt van al het bestaande materiaal.
Een overzicht van wat er aan coupes al gescand is kun je downloaden via deze link.
We zijn ook een overzicht aan het maken van de coupes die in het KBG opgeslagen liggen. Een overzicht hiervan kun je downloaden via deze link.